Hi Bernd,
an jedem IDE-Bus kannst du 2 Laufwerke anschließen, ein "Master" und ein "Slave". Welches davon als Master und welches als Slave fungiert, wird mit Hilfe von sog. Jumpern festgelegt, die über 2 Metallpins an der Gehäuserückwand aufgesteckt werden. Das sieht etwa so aus:

Leider habe ich kein besseres Bild gefunden - typischerweise sind Jumper schwarz, nicht weiß. Wo du die Jumper aufstecken musst, um das Laufwerk als Master bzw. Slave zu bestimmen, kannst du den Anleitungen der Laufwerke entnehmen - noch einfacher: auf den Gehäuse-Aufklebern solltest du jeweils eine kleine Skizze finden, welche Jumperung was bedeutet.
Solltest du an einem IDE-Bus zwei Master bzw. zwei Slaves anstatt je einem von "jeder Sorte" angeschlossen haben, kann es zu Problemen kommen, so wie du sie beschrieben hast. Wenn du ein neues Laufwerk einbaust, ist es zunächst purer Zufall, ob die ab Werk vorgegebene Jumperung bei dir hinhaut, du musst schon sehen, ob es passt und ggfs den Jumper neu setzen.
CU
Olaf