...so die Externe Platte einen USB2.0/Firewire Combicontroller besitzt und diese beide mal am gleichen PC angeschlossen wurden könte genau darin das Problem zu suchen sein. Was ich mal versuchen würde ist das Umbauen beider Festplatten der Externen Gehäuse. Da mir nicht bekant ist ob diese Gehäuse einen identischen Controller besitzen kann auf diese weise zumindest die eigentliche Festplatte als Fehlerursache Ausgeschlossen werden.
USB reagiert im gegensatz zu Firewire nämlich äußerst zickig wenn mehrere Wechseldatenträger mit ähnlichem Controller (z.b.Digicam/MP3 Player/Kartenleser/Externe Festplatte) mal instaliert worden sind. Weil USB einfach zu blöd ist diese Geräte als Induvidien zu unterscheiden eine und die selbe Sache zweimal zu instalieren das geht dann einfach nicht, manche User haben sich damit beholfen dafür eine eigene Batchdatei zu schreiben die bei Anschluß eines Problem USB Gerätes die eine Instalation vorübergehend zurücksetzt.
Das kann wie gesagt eine Ursache sein.
Sofern das Problem erst mit Win2K SP4 aufgetreten ist kommt auch dieses als Fehlerursache in Frage, auch bei diversen XP Patches gab es nach deren instalation mitunter unzumutbare Probleme denen nur mit deinstalation des zuvor instalierten Patches wieder beizukommen war.