Bombenleger Nachtrag zu: „LigandFit now being Scheduled.“
Habe gerade LigandFit NT_0.1.1 (2809) erhalten und bin recht ueberrascht. Der Agent ist weiterhin 3.0 (2809).
1. Der "energy grid completed" dauert gerade mal 3 m, wofuer der auch immer ist
2. der eigentliche Crunchprocess lautet dann "starting docking run"
3. Das "Current Protein Target" sieht aehnlich wie bei THINK aus, allerdings ohne Beschreibung
4. Die "Legend" ist so umfangreich das deren Inhalt wechselt
5. Die Grafik der "Current Prospective Ligand 3D Structure" dreht sich
6. Es gibt keine Derivate mehr, sondern "x of xx Ligands processed", wobei xx von UD vorgegeben wird
7. Nach einem Reboot und manuellem Restart wird 1. erneut gestartet und setzt dann nach ca. 7 m bei 6. fort
8. Nach Ende einer WU entsteht eine wahre Sendeorgie (bis zu 2 m bei DSL)
Geschwindigkeitsmaessig sieht es so aus:
- x of xx Ligands processed = 1 % im Agent gleich x of (xx / 100) ligands
- jeder ligand (x) kann bis zu 7, auch weniger, verschiedene 3D-Strukturen haben
- pro Agent-% sind bei 1470 MHZ zwischen 3 und 7 m einzuplanen (variabel)
- Eine aktuelle LigandFit-Statistik gibt es hier
Was gibt es sonst noch:
- Hits, wie bei THINK, gibt es nicht mehr, denn alle WUs sind Ex-THINK-Hit-WUs
- UD-Mon (1.7.5c) laeuft auch mit LigandFit (noch ohne Kennung), fuer alle die den nutzen
- an den ZA-Einstellungen muss nichts geaendert werden
- BlackIce ab 3.5 muessen die Advanced Application Protection neu erstellen (2 neue UD-Teile)
- nach jedem neuen receive muss mit BI 3.5 und App-Protection ein Modul mit "continue" bestaetigt werden (Ud_ligfit_Release.exe)
Fuer alle die noch THINK laufen haben, so sieht es im Grafikfenster aus:
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Fratercula Bombenleger „LigandFit now being Scheduled.“
Ich habe 90% nach fünf Stunden. Mal sehen, wie lange es komplett dauert!
Fratercula Nachtrag zu: „Ich habe 90 nach fünf Stunden. Mal sehen, wie lange es komplett dauert!“
Jetzt habe ich aktuelle Daten. Meine Rechenzeit liegt mit 300 ligands bei 6h. Das letzte Paket hat schon 330 ligands. Mal sehen wie es weiter geht. Die Grafik ist auch ein bischen schöner geworden :-)
Bombenleger Fratercula „Jetzt habe ich aktuelle Daten. Meine Rechenzeit liegt mit 300 ligands bei 6h....“
... auf einen connect. Sending (40 x dasselbe result_0 mit 1.75 MB)
klappt noch aber receiving 565 of 541 endet in unable to connect.
Wahrscheinlich ist UD mit worldcom verheiratet, versuchen gerade
ihre Bilanzen gerade zu biegen und brauchen dafuer die Rechner. *g*
PS: Meine letzten 310 ligands haben 5 h 40 m 21 s benoetigt
Update: Ja ist es denn die possibility: Um 23:55 gab es eine neue Ligand-WU.
Ich hatte ja schon ueberlegt ob die UDler Brasilianer sind und das WM-Finale
live vor Ort miterleben wollen.
Hoffen wir mal das die naechsten WUs schneller zu haben sind.
Happy LRM-/Ligand-crunching, gute Nacht und schoenen WM-Sonntag
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