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Neues THINK und neues Protein !

Bombenleger / 28 Antworten / Baumansicht Nickles

Hi Cruncher

Dieses Posting diente bis 14.12.2001 als Fortschritts-News in Sachen aktueller UD-Updates.

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In naechster Zeit kann es Download-Schwierigkeiten geben:

THINK-Update und die neuen Proteine

- "Fibroblast GF Recept." 1AGW (FGF) (aehnelt Q3 und ist Kinase):

==> 12 Molekuele à 100 Derivate je % = 1200 Molekuele je WU = LRMs

- "Cyclin Dep. Kinase 2" 1AQ1 (CDK2) (Spaghetti-Eis ?):

==> 20 Molekuele à 100 Derivate je % = 2000 Molekuele je WU = MfHs (?).

Depends on how you define LRM.

Some people call a LRM something that runs more than an hour. Some
people call it something that runs more than 5 hours. Others think
something longer than 50 hours LRM...

Expected run time for a WU is 15-20 hours on a PII 400. Will they run
past that? Yes. However timing tests done in beta and alpha wus
averaged ~20 hours or so. But as usual there is no real way to tell if
a WU is a LRM until it is run.

Thanks
moose


Und ich dachte immer die wuerden ihr Comparison Device crunchen lassen.

Happy crunching und nicht sauer sein wenns ab jetzt laenger dauert ...

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Was hat sich eigentlich ausser dem Grafikupdate im THINK geaendert ?

Es ist kaum zu glauben, aber die Eigensicherung, ohne Hilfsmittel,
findet jetzt jeweils nach jedem beendeten Molekuel statt bzw. alle
100 Derivate. Das nenne ich Fortschritt, denn vorher wurde ja nur
jedes volle % gesichert und das wuerde bei 1AGW, 1AQ1 erheblichen
Zeitverlust bedeuten, wenn innerhalb eines % der Agent beendet wuerde.

Jetzt meint Ihr bestimmt, was denn, vorher hatte 1 % nur 1 Molekuel.
Das mag bei RAS, 6COX noch stimmen, aber VEGF und SOD haben 2 je %
und die TKs mindestens 2. Nur bei den neuen faellt es auf das je
Molekuel gesichert wird, waehrend bei den alten fruehestens je %
gesichert wurde. Das liegt aber daran das die Molekuele der alten
um einiges schneller, da weniger umfangreich, berechnet wurden.

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Was hat sich durch diese Updates im Agenten geaendert ?

Absolut nichts. Ich hatte mich schon mehrfach beschwert das die Zeit/Punkte
im Agenten von den Web-Statistiken abweicht und es sollte jetzt behoben
sein. Alles Quatsch. Das einzige was die behoben haben war die Anzeige-
differenz zwischen der Member- und Team-Statistik in den Web-Routinen.
Im Agenten selbst sind zwar minimale Unterschiede, aber was stimmt denn
nun ? Kurz nachdem THINK fertig ist kann man noch die Task-Time im
Agenten sehen, bevor er auf Preparing/Analyzing/Connecting wechselt.
Genau diese Zeit wird zum vorherigen Gesamt im Agenten addiert. Das
bedeutet also der Agent stimmt und die Web-Statistiken "schoenen",
wenn sie ueberhaupt "upgedated" werden (von regelmaessig keine Spur).

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PS: RM hat seine alte Page wieder online.

Damit UD-Mon die Teil richtig erkennt, einfach die UD_Mon.ini editieren
und unter proteins die Zeilen 891437=1AGW und 897782=1AQ1 einfuegen,
wenn das Frontend selbst keine Moeglichkeit zur Anpassung bietet.
Desweiteren sind im entsprechenden Cache alle ud_7xxx.exe, sowie
ud_7xxx.dll ueberfluessig, denn das neue THINK benutzt jetzt ud_895166.exe
und ud_895167.dll, natuerlich nur wenn der Cache bereits "upgedated" ist.



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Meinersen20 Bombenleger „Neues THINK und neues Protein !“
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Voll die Seuche.
Wie oft wird denn da ein Prozent durchgerechnet ???
Mir scheint es sind 4 Teile a´100.
Das dauert.....................................

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Bombenleger Meinersen20 „Voll die Seuche. Wie oft wird denn da ein Prozent durchgerechnet ??? Mir scheint...“
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Hi meinersen

1AGW (FGF) hat 12 Molekuele à 100 Derivate je % = 1200 Molekuele je WU.
Das brachte eine 1. Endzeit von 08:44:43, 3 Hits und mageren 200 Punkten.
Die 2. war mit 08:13:04, 8 Hits und 187 Punkten nicht viel besser.

Was aber wichtiger ist, die Teile stressen die CPU dermassen das die
UD-CPUTemp 4° Grad hoeher liegt, als mit den 1IEP (C-ABL) oder 6COX (COX-2).



[Diese Nachricht wurde nachträglich bearbeitet.]

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K!llkenny Bombenleger „Neues THINK und neues Protein !“
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ich hab grad nen fgf am laufe. 37:22:00 und 66%. ist das noch normal? oder verrechnet sich hier irgendwas? naja, hauptsache ist, dass jetzt relativ ordentlich gesichert wird. hatte bis jetzt weniger als 3min verlust, wenn man den client beendet. *begeistert* im prinzip sind die langen zeiten für modemuser von vorteil. braucht ma halt nicht mehr so oft ins netz *lol*

wuselgruss kenny

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Bombenleger K!llkenny „ich hab grad nen fgf am laufe. 37:22:00 und 66 . ist das noch normal? oder...“
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Hi Kenny

Ich habe gerade einen neuen negativen Zeitrekord fuer schnelle Rechner aufgestellt:

36:33:06 = my new Time Record, 15 Hits, 835 Points.

Jetzt habe ich ein 1AQ1 (CDK2/Spaghettieis) am Wickel: 02:15:00, 30 %, 17 Hits.

Hoffentlich kann dann wieder wenigstens 1 WU taeglich abgeschickt werden.

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K!llkenny Bombenleger „Hi Kenny Ich habe gerade einen neuen negativen Zeitrekord fuer schnelle Rechner...“
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au backe, dann hab ich ja noch ein paar stündchen vor mir.
solange gesichert wird, solls mir recht sein.

kenny's never die

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Bombenleger K!llkenny „au backe, dann hab ich ja noch ein paar stündchen vor mir. solange gesichert...“
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Hi Kenny

Herzliches Beileid, aber Luftspruenge sind trotzdem nicht angebracht.
Mein Spaghetti war nach 07:05:08 mit 29 Hits fertig, danach kam noch
ein C-ABL mit 01:45:23 und jetzt wieder ein Spaghetti. Was bei den
Dingern jedenfalls auffaellt ist das die einzelnen Derivate weniger
umfangreich wie die vom FGF sind und dadurch schneller berechnet werden.
Da aber 8 Molekuele mehr je % eingebunden sind (ja, tatsaechlich 20),
relativiert sich das ganze wieder und es stehen horrende Laufzeiten ins Haus.

Gruss und schoenes (Rest-) Wochenende

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K!llkenny Bombenleger „Hi Kenny Herzliches Beileid, aber Luftspruenge sind trotzdem nicht angebracht....“
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kannst du ma das fachchinesisch ein bissl entklamüsern. versuch es bitte, damit ich auch versteht, was du da erzählst. also % is klar. dann im think unten links immer eine zahl bis in >100000 und dann kann man noch sehen, das oben (am ende von blabla) immer von 1-100 durchläuft. was sind jetzt derivate?

*nixpeil*

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Bombenleger K!llkenny „kannst du ma das fachchinesisch ein bissl entklamüsern. versuch es bitte, damit...“
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Hi Kenny

Schlag mich jetzt nicht, aber ich beschreibe mal meine Vorstellung:

- Protein besteht aus mehreren
- Molekuelen (Molecule) und die wiederum aus mehreren
- Derivaten (Abschnitte) die wir berechnen sollen, diese haben bestimmte
- de novo structures (Strukturen) und die legen wiederum die
- conformers (Uebereinstimmungen) fest, auch wenn grafisch nur die 1. angezeigt wird

denn ich weiss es zugegebenerweise auch nicht so richtig.
Je mehr conformers vorhanden sind um so umfangreicher die Berechnung.
Wie findest Du meine persoenliche UD-Statistik (ohne HTML-Kenntnisse) als VK ?

Schoenen (Rest-) Sonntag

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K!llkenny Bombenleger „Hi Kenny Schlag mich jetzt nicht, aber ich beschreibe mal meine Vorstellung: -...“
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und was is nu was in der think-grafik?

"Wie findest Du meine persoenliche UD-Statistik (ohne HTML-Kenntnisse) als VK ? "
wenn du mir noch erklärst, was genau du jetzt von mir willst *lol*
wat hat deine statistik mit html zu tun? *nixpeil*

kennys never die

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Bombenleger K!llkenny „und was is nu was in der think-grafik? Wie findest Du meine persoenliche...“
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Ich glaube ich werde mich auch hier abmelden muessen. Ich dachte wenigstens
auf diesem Brett waeren vernuenftige Nicht-PISA-Geschaedigte unterwegs.
Wie man sich doch taeuschen kann. Mittlere Wechselgrafik = 1. conformer
und rechts das Protein. Was die VK angeht, vergiss es.
Frohes (?) Fest und guten (EURO-) Rutsch

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K!llkenny Bombenleger „Ich glaube ich werde mich auch hier abmelden muessen. Ich dachte wenigstens auf...“
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man könnte fast denken, dass du "bockig" bist.
das links die stoffe stehen und rechts das protein auf welche diese getestet werden, wusste ich auch. meine frage bezieht sich dierekt auf die zahlen im linken feld. :-P

schönen gruss an die frau gemahlin,
sie soll dich nich immer so ärgern.
alter bock

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Bombenleger K!llkenny „man könnte fast denken, dass du bockig bist. das links die stoffe stehen und...“
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Hi Kenny

Endlich einer der es erkannt hat, ich bin nicht nur alt sondern fuehl
mich auch so. Die Bezeichnung finde ich gut, ist die als User noch frei ?

Hier ist die englische Beschreibung zu THINK.

Habe das Teil mal von dictonary.com uebersetzen lassen und das kam
dabei raus (ist etwas spaet es anzupassen deshalb 1 : 1 reinkopiert):

DENKEN erklärtes Screensaver

DENKEN
DENKEN ist ein Drogeentdeckungsoftware-Programm. Das Programm bewertet jedes von Hunderten Millionen Molekülen, um zu sehen, wenn sie wahrscheinlich sind, auf ein Zielprotein einzuwirken. DENKEN Sie errechnet und studiert die vielen möglichen Formen, oder conformers, das Molekül konnten das Einwirken auf das Protein annehmen. Dieser Prozeß wird virtuelle Siebung der Moleküle genannt.

Conformers
DENKEN erforscht die 3-dimensional Formen, die jedes Molekül annehmen konnte. Jede neue Form der Moleküle kann den rechten Teilen des Moleküls helfen, das mit dem Proteinziel interaktiv ist. DENKEN Sie tut dieses sehr schnelle-so schnelle Ihr Monitor kann nicht jedes Molekül oder Anpassung zeigen. Deshalb bewegt die Anpassungzahl so schnell. Die Gesamtzahl conformations unterscheidet sich Molekül zum Molekül. Einige Moleküle können mehr Bindungen oder Flexibilität haben und folglich werden mehr conformers haben.

Aktuelles Molekül
Die 3-dimensional Bilder auf dem links sind Darstellungen der realen Moleküle. Die Darstellungen bestehen verschiedene Atome und Bindungen, die erscheinen, während farbige Kugeln zusammen mit Stöcken sich setzen. Die " Stöcke " stellen die Bindungen zwischen den Atomen dar. Die " Kugeln " stellen unterschiedliche Atomelemente, die das Molekül bilden, mit unterschiedlichen Farben dar, um spezifische Elemente darzustellen.

Molekularer Name
Dort sind Hunderte Millionen Moleküle, die verarbeitet werden. Es gibt so viele, denen Kennungen, eher dann Namen, benutzt werden, um sie aufzuspüren. Die Zeichen, die den Wörtern " aktuellem Molekül " folgen, zeigen an, daß das Molekül, das DENKEN, aktuell rastert.

Aktuelles Proteinziel
Das Bild am Recht des Bildschirms stellt ein Protein dar, das die Moleküle einwirken können auf. Das Protein ist bereits festgestellt worden, um ein mögliches Ziel für Krebstherapie zu sein. **time-out** es sein ein von nur einig Protein Ziel daß d Millionen von Molekül sein rastern gegen für dies Projekt, also d gleich Protein Ziel werden sein kennzeichnen auf d Bildschirm Retter für eine Weile.

Atomlegende,
was Elemente jedes Molekül bilden? Sie können die elementaren Bestandteile der Moleküle abbilden, indem Sie die Legende verwenden, die Codes die Elemente färben. Es gibt einige Primärelemente, die alle biologischen Moleküle bilden, die auf die Legende gesehen werden können: Carbon, Sauerstoff, Wasserstoff, Stickstoff und Schwefel.

AtomHetero
Hetero Mittel " unterschiedlich ". Eigenschaft einiger schließt Primärelemente stark in den biologischen Molekülen, aber manchmal ein Molekül ein Atom mit ein, das nicht eins der üblichen biologischen Elemente ist. Ein heteroatom könnte jedes unterschiedliche Atom sein, das nicht in der Legende dargestellt wird. Z.B. kann es Chlor sein, oder es kann ein anderes Element sein. Das heißt, bedeutet die heteroatomfarbe jedes andere unterschiedliche Atom, das nicht eins der üblichen fünf Atome ist, die den meisten lebenden Stoff bilden.

Hit
wenn eine molekulare Anpassung ankoppelt erfolgreich und startet eine Abhängigkeit mit dem Protein, es registriert, wie ein " Hit.", Hits haben unterschiedliche Stufen der Stärke, aber irgendeine geschlagen kann die sein, die schließlich zu eine Heilung führt. Alle Hits werden für das folgende Stadium des Projektes gespeichert, geordnet für Stärke der Abhängigkeit und archiviert.

Strukturen De Novo
manchmal ein Molekül können Extrapotential haben, wenn es etwas auf gewisse Weise geändert wird. DENKEN Sie betrachtet kleine Varianten oder Atomersatz, die Zahl den Molekülen zu erhöhen, die ausgewertet werden. Diese neuen geänderten Moleküle sind Ableitungen de Novo oder Strukturen, die auch auf dem screensaver aufgespürt werden.

Fortschrittstab
der Stab entlang der Unterseite der Molekülgraphik zeigt, wie weit entlang in der Arbeitsmaßeinheit Ihr PC weitergekommen ist. Eine Arbeitsmaßeinheit wird von einigen Molekülen enthalten. Die Moleküle können in Größe und in Zahl von conformers beträchtlich schwanken, wenn die flexibleren Moleküle länger zu rechnen nehmen. Diese Vielzahl in den Molekülen ist, was die Vielzahl der Zeit berechnet, die sie zu den kompletten unterschiedlichen Arbeitsmaßeinheiten dauern kann.

Knöpfe
die Tasten auf der graphischen Schnittstelle erlauben Zugriff zu mehr Informationen über das Projekt und die Arbeit, die Ihr spezifischer Computer erledigt. **time-out** dies umfassen Information über wie es vergleichen zu ander Computer, und was Ihr Mittel Präferenz sein, welch sein wie Sie wünschen d Mittel zu laufen lassen auf Ihr Maschine.

Solltest Du bis hierhin unfallfrei gekommen sein wuensche ich viel
Spass beim vermehren der gewonnenen Einsichten, sowie eine gute Nacht.

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GTFreak Bombenleger „Neues THINK und neues Protein !“
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Hi,

neues Protein ist gut, ein Riesensch... ist das!
Der UD-Monitor hängt sich immer phänomenal auf, weisser Streifen über den Bildschirm von oben nach unten, Fehlermeldung "I/O Error 1450" und die Benachrichtigung, das ein neues Protein gefunden wurde.

Nichts geht mehr, die Kiste muss neu gebootet werden!

cu,
GTFreak ©
Tuning-Freeware.de


PS: Roman weiss Bescheid!

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Meinersen20 GTFreak „Hi, neues Protein ist gut, ein Riesensch... ist das! Der UD-Monitor hängt sich...“
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Passierte mir auch !!
Aber nur unter W2K
Habe dann die ini gelöscht
den Monitor neu eingerichtet
danach war alles in Ordnung
schon probiert ?

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GTFreak Meinersen20 „Passierte mir auch !! Aber nur unter W2K Habe dann die ini gelöscht den Monitor...“
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Hey, gute Idee, ich verwende nämlich auch Win2k.

Danke,
GTFreak ©
Tuning-Freeware.de

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Meinersen20 GTFreak „Hey, gute Idee, ich verwende nämlich auch Win2k. Danke, GTFreak Tuning-Freeware.de“
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Hatte ich schon mitbekommen und deshalb meinen Senf dazugegeben.

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GTFreak Meinersen20 „Hatte ich schon mitbekommen und deshalb meinen Senf dazugegeben.“
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Hi meinersen,

Roman schreibt zu dem Fehler:

Hi, Stephan!
> hi roman,
> with the last version of the monitor do i get the following error: "I/O
> Error 1450". this error comes after ending a work unit and beginning a new
> one, when a new protein is detected.

Thanks. I did not found this error number in the manuals yet, however
there are some problems with the New Protein form, which should be
adressed in the next version. So, it may also help with solving the
problem you described.

Best Regards,
Roman


cu,
GTFreak
Tuning-Freeware.de

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Meinersen20 GTFreak „Hi meinersen, Roman schreibt zu dem Fehler: Hi, Stephan! hi roman, with the last...“
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Da haben wir die Bescherung, obwohl Weihnachten noch lange nicht ist.
Harren wir also der Dinge die da kommen werden.

Bei mir sind nach der zuvor beschriebenen Vorgehensweise keinerlei Probs mehr aufgetaucht.
Und wie siehts bei dir aus ??????????????????

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GTFreak Meinersen20 „Da haben wir die Bescherung, obwohl Weihnachten noch lange nicht ist. Harren wir...“
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Hab noch keine Zeit gehabt!
Ich versuche immer noch, beide Prozzis auf den jeweiligen Boards richtig zum Laufen zu kriegen!

cu,
GTFreak
Tuning-Freeware.de

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Meinersen20 GTFreak „Hab noch keine Zeit gehabt! Ich versuche immer noch, beide Prozzis auf den...“
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Hab´s gelesen viel Glück dabei.
Und das schnellstens, damit du weiter mitrechnen kannst.

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polytaen Bombenleger „Neues THINK und neues Protein !“
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Hi ihr,
das kam vom Bombenleger:

> - Protein besteht aus mehreren
> - Molekuelen (Molecule) und die wiederum aus mehreren
> - Derivaten (Abschnitte) die wir berechnen sollen, diese haben
> bestimmte
> - de novo structures (Strukturen) und die legen wiederum die
> - conformers (Uebereinstimmungen) fest, auch wenn grafisch nur die
> 1. angezeigt wird


Nun ich kenn das Projekt an sich nicht so gut, bin aber in der Materie fit (ui klingt das arrogant, solls aber nicht) und hab gerade THINK heruntergeladen und bin dem Team nickles beigetreten. So wie ich das sehe macht ihr folgendes:

Protein = Eiweiss im menschlichen Körper (daraus besteht alles), das können z.B. Werkzeuge des Körpers sein; Schneidewerkzeuge etc.

Molecules = Teile, die in das aktive Zentrum das Eiweiss' (Proteins) reinpassen sollen, nach dem Schlüssel-Schloss-Prinzip

Derivate = Verändertes Molecule. Um ein Schlüssel genau anzupassen wird er etwas verändert (derivatisiert). Das kann man mit dem "Zurechtschleifen" des Bartes eines Schlüssels vergleichen, nur komplizierter, diese Dinger berechnet man und schaut, ob sie reinpassen

de novo structures = neue Strukturen, die neu berechnet wurden (de novo = aus dem nichts, neu). Hab ich noch nicht bei mir im client gefunden, werd aber mal schauen. Vermutlich werden aus existierenden Molekülen die am besten passende genommen, Zwischenstufen berechnet und diese wieder in das Protein gefittet.

conformers = sind vermutlich potentielle Molekülderivate, die sehr gut in das Protein zu passen scheinen. Diese müssen experimentell überprüft werden, oder aus diesen werden de novo structures berechnet.

Das "current Protein target" ist das Protein, für das die "Schlüssel" bzw. "Molecules" berechnet werden.

Klingt alles unglaublich kompliziert. Isses aber eigentlich nicht. Der Ansatz ist interessant, da ich Moleküle für Cyclooxygenase2 berecne. Ich weiss nicht, was die mit Krebs zu tun hat, werd mich aber mal schlau machen.

Bis denne
poly

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Bombenleger polytaen „Hi ihr, das kam vom Bombenleger: - Protein besteht aus mehreren - Molekuelen...“
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Hi poly

Was soll ich denn sonst posten, bin kein Chemiker oder wozu sowas gehoert.
Soviel ich weiss dient das ganze der Medikamenten-Forschung gegen
Krebserreger, denn die Oxford-Uni waehlt die zu pruefenden Proteine
aus. United Devices dagegen bereitet diese Proteine entsprechend
berechen- und anzeigbar in kleine Stueckchen auf und schickt die uns.

Na dann mal willkommen im Team. Du kannst ja mal unsere kleine UD-Page
besuchen und wenn Du willst auch gleich die Rechner-/Perfomancedaten,
anhand der dortigen Spalten schicken (E-Mail in Rechnerdaten).

Noch was zum Agenten. Unter Preferences "Screen Saver" deaktivieren und
den Agenten (UD.exe) immer im Hintergrund laufen lassen. Das Prinzip
von dem Teil ist sinnvoll, denn es nutzt nur die Leerlaufzeiten, sodass
andere Sachen in keinster Weise beeinflusst bzw. ausgebremst werden.

Happy crunching, auch wenn es manchmal etwas sehr viel laenger dauert,
Andreas

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polytaen Bombenleger „Hi poly Was soll ich denn sonst posten, bin kein Chemiker oder wozu sowas...“
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Hi Andi,

> Was soll ich denn sonst posten, bin kein Chemiker oder wozu sowas
> gehoert.
> Soviel ich weiss dient das ganze der Medikamenten-Forschung gegen
> Krebserreger, denn die Oxford-Uni waehlt die zu pruefenden Proteine
> aus. United Devices dagegen bereitet diese Proteine entsprechend
> berechen- und anzeigbar in kleine Stueckchen auf und schickt die
> uns.

Nein, nein, ich wollte DIr damit nicht ans Bein pin.eln. Ich bin halt n Biokomiker und daher weiss ich n büschen Bescheid und ich denke die Leute könnte das interessieren.

> Na dann mal willkommen im Team. Du kannst ja mal unsere kleine UD-
> Page
> besuchen und wenn Du willst auch gleich die Rechner-> /Perfomancedaten,
> anhand der dortigen Spalten schicken (E-Mail in Rechnerdaten).

Werd ich morgen machen. CIh muss jetzt ne Tequilla party bei mir organisieren und bin deshalb quasi weg (sorry für Tippfeheler).

> Noch was zum Agenten. Unter Preferences "Screen Saver" deaktivieren > und
> den Agenten (UD.exe) immer im Hintergrund laufen lassen. Das
> Prinzip
> von dem Teil ist sinnvoll, denn es nutzt nur die Leerlaufzeiten,
> sodass
> andere Sachen in keinster Weise beeinflusst bzw. ausgebremst
> werden.

Tnx für die Tips.

> Happy crunching, auch wenn es manchmal etwas sehr viel laenger
> dauert,
freu mich schon drauf!!!
> Andreas

Bis denne

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Bombenleger polytaen „Hi Andi, Was soll ich denn sonst posten, bin kein Chemiker oder wozu sowas...“
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Hi poly

Na, alles gut und schmerzfrei ueberstanden ? Da Du vom Fach bist braeuchte
ich mal eine Auskunft. Jedes Protein hat doch ein Kuerzel, z.B. 6COX fuer
Cyclooxygenase-2. Ein Kuerzel fehlt mir allerdings noch und zwar zu
Tyrosine Kinase (Q3). Waerst Du so freundlich und klaerst mich auf ?

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polytaen Bombenleger „Hi poly Na, alles gut und schmerzfrei ueberstanden ? Da Du vom Fach bist...“
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Uiuiui, mein Kopf *aspirin!!*
deswegwn kommt das posting auch so spät *g*

das is natürlich schon heftiger.
Tyrosinkinasen gibts wie Sand am Meer. Cyclooxygenasen nur 2. Ich habe übrigens rausgefunden, warum ein Cox2-Inhibitor (Melecule, bzw. derivate, die ihr berechnet) Krebs bekämpfen kann.

Aspirin gehört zu den NSAIDs (non steroidal anti-infalmmatory drugs), also schmerzstillern. A. blockiert Cox1 und Cox2 reversibel. Cox1 wird aber gebraucht, um die Magenschleimhaut zu regenerieren, daher bekommt man von zu viel A-einnahme Magengeschwüre.

Im Prinzip rechnet ihr (rechnen wir) nach Aspirinderivaten, die spezifisch nur die Cox2 inhibieren, nicht jedoch Cox1. Wenn man Cox1 mitinhibiert, bekommt man die Berhühmten Magengeschwüre und die will man ja nicht. Man hat rausgefunden, dass geringe Mengen an Cox2-Inhibitoren Krebs verhindern können (Lungenkrebs) wenn mehr info gewünscht nur anfragen.

Zu Tyrosinkinase....was heisst Q3, bzw. wo hast Du die Info her?

werd mich mal weiter schlau machen.

Bis denne
poly

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polytaen Bombenleger „Hi poly Na, alles gut und schmerzfrei ueberstanden ? Da Du vom Fach bist...“
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Hi Andreas ich nochmal,

ich kann diese Nomenklatur nicht bestätigen. 6COX muss ein interner Name von UD sein (könnte es auch GCox sein?). Wenn du mehr über die Proteine wissen willst, schau mal hier nach:

http://us.expasy.org/

alles über humane COX2 findest Du hier:

http://us.expasy.org/cgi-bin/niceprot.pl?P35354

Viel spass ncoh
poly / Gregor

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Bombenleger polytaen „Hi Andreas ich nochmal, ich kann diese Nomenklatur nicht bestätigen. 6COX muss...“
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Hi Gregor

Klick mal in meiner VK auf den Zugenrausstrecker, dann weisst Du was wir
bisher beackert haben. Sagt Dir das Protein-Kuerzel RAF was ?
UD-Gruss und vorab schoenes Wochenende, Andreas

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polytaen Bombenleger „Hi Gregor Klick mal in meiner VK auf den Zugenrausstrecker, dann weisst Du was...“
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Servus,

uiuiiu , imposant (im hintern kies *g*). Ich werd' mal hinne kachen und sehen, was ich beitragen kann. Bin aber gerade daheim (Weihnachten mit family) und daher an nem fremdrechner. Daten kommen bald, der Rechner kann ja auch offline rechnen.

Raf.. ja! WICHTIGES Krebsprotein. Ist in einer Signalkaskade, die das Zellwachstum steuert (Krebs ist ja nichts anderes als unkontrolliert wuchernde Zellen). Wenn das kaputt ist, bekommt die Zelle dauernd das signal sich zu teilen (primitiv ausgedrückt).
Die Signalkaskaden fünktionieren wie ein schneeballprinzip. d.h. auf der Zelle ist ein Rezeptor, der ein Signal bekommt. Dann kommen interne Proteine, die das Siganl immer weiterreichen und dabei verstärken. Raf interagiert mit Ras (habt ihr auch schon gerechnet) usw. Raf ist extrem gefährlich... mehr wenn ihr mich wiederseht. *g*

1AGW (FGF) f? growth factor
1AQ1 (CDK2) Cyclin dependent kinase
1FLT (VEGF) vaso-epidermal growth factor
1IEP (C-ABL) ???
1IR3 (PTK)P? Tyrosin kinase
1ISA (SOD) Superoxiddismutase
6COX (COX-2) Cyclooxygenase 2
821P (RAS) Ras-Raf-Signalkaskade
Q3 (Tyrosine Kinase) irgendeine TK

GFs sind Wachstumsfaktoren, d.h. Rezeptoren auf der Zelle. Wenn hier ein Signal ankommt, wird es über Siganlkaskden (s.o.) IN der Zelle weitergeleitet und verstärkt, dadurch entsteht ein Signal im Kern der Zelle, dass sie sich teilen soll. Man kann verstehen, dass wenn der Rezeptor mutiert, und er dauerhaft ein Signal abgibt, dass sich die Zelle unkontrolliert teilt und Krebs entsteht. Daher die Suche nach inhibitoren.

Rezeptortyrosinkinasen...Wie GFs, nur dass sie über eine andere art Signalkaskaden wirken.

Ras-Raf sind teile solcher Signalkaskaden.

SOD2 ist zur entgiftung von Radikalen (böse chemische Teilchen) im Menschen. Wenn zu viele radikale auftauchen, wird die DNA (ergbut) des Menschen beschädigt, dadurch entstehen Mutationen, die Krebs auslösen können.

Die Nummern am Anfang kann ich nicht zuordnen, müssen tatsächlich interne Nomenklaturen sein.

Bis denne
poly

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