Dies ist eine heikle Frage von der wohl in Zukunft einige betroffen sein werden, den scheinbar ist es so, dass neue PCIe 2.0 Grafikkarten nur auf Mainboards laufen werden welche über einen PCIe 1.1 Steckplatz verfügen. Dies wären dann in Normalfall die meisten Boards welche nach 2004, aber wohl eher weit ins Jahr 2005 auf den Markt gekommen sind. Mainboards welche noch den alten PCIe 1.0/1.0a verbaut haben werden schlicht nicht anspringen da diese nicht mehr kompatibel sind. Das Problem ist nun aber, dass auch sehr aktuelle Boards wie etwa das Blitz Extreme und Blitz Formula von Asus, also sehr teure topaktuelle P35-Bretter, scheinbar noch minimum einen PCIe-Slot in der alten Version (also 1.0 oder 1.0a) haben, um technisch auch auf dem P35-Chipsatz einen SLI-Betrieb mit einem 8x Betrieb auf beiden Steckplätzen zu realisieren. Was sonst scheinbar mit zwei neuen Steckplätzen nicht möglich ist.
Wie es allerdings nun in deinem Fall aussieht musst du wohl mal in einer Mail an AMD/ATI klären, im Normalfall sollte dein Mainboard aber kompatibel zu den kommenden PCIe2.0-Grafikkarten sein.